236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4275 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4275  metallophosphoesterase  100 
 
 
310 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.221953  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0339  metallophosphoesterase  70 
 
 
303 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0118418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4826  metallophosphoesterase  52.65 
 
 
327 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4912  metallophosphoesterase  52.65 
 
 
327 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745851  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5213  metallophosphoesterase  52.65 
 
 
327 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349162  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0509  metallophosphoesterase  51.84 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36260  predicted phosphohydrolase  50.68 
 
 
313 aa  272  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.856531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0706  metallophosphoesterase  52.33 
 
 
323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5443  metallophosphoesterase  51.89 
 
 
324 aa  269  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13714  hypothetical protein  51.89 
 
 
319 aa  268  7e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.1181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0233  metallophosphoesterase  50.67 
 
 
319 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1364  metallophosphoesterase  49.66 
 
 
321 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793805  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0594  metallophosphoesterase  49.45 
 
 
296 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2006  metallophosphoesterase  50.17 
 
 
299 aa  260  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4798  metallophosphoesterase  49.46 
 
 
297 aa  259  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0458  metallophosphoesterase  48.64 
 
 
307 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4356  metallophosphoesterase  49.46 
 
 
297 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3959  metallophosphoesterase  51.45 
 
 
317 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0324  metallophosphoesterase  50.16 
 
 
320 aa  255  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0707636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25470  predicted phosphohydrolase  47.92 
 
 
353 aa  255  8e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3181  metallophosphoesterase  47.64 
 
 
314 aa  252  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0493  metallophosphoesterase  49.64 
 
 
321 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0193  metallophosphoesterase  49.1 
 
 
318 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.749364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4919  metallophosphoesterase  46.94 
 
 
300 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04850  predicted phosphohydrolase  48.94 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.637167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0432  metallophosphoesterase  50.72 
 
 
308 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0982928  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3100  metallophosphoesterase  51.55 
 
 
327 aa  242  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.795992  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0603  metallophosphoesterase  50.5 
 
 
308 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0107  hypothetical protein  46.13 
 
 
306 aa  238  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163449  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5305  metallophosphoesterase  47.59 
 
 
306 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0431  metallophosphoesterase  47.37 
 
 
315 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.333849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3400  metallophosphoesterase  49.46 
 
 
314 aa  228  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190483  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3042  metallophosphoesterase  48.17 
 
 
317 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9014  metallophosphoesterase  43.69 
 
 
327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23893  normal  0.0665551 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18470  predicted phosphohydrolase  47.3 
 
 
322 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26290  predicted phosphohydrolase  47.37 
 
 
311 aa  202  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3810  metallophosphoesterase  35.99 
 
 
284 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2349  metallophosphoesterase  28.47 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0175876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3715  metallophosphoesterase  34.83 
 
 
284 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.715212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1255  metallophosphoesterase  30.84 
 
 
273 aa  85.9  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2596  phosphoesterase  27.45 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.899724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2541  hypothetical protein  27.18 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000889326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2504  phosphoesterase  26.64 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2819  phosphoesterase  26.64 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1476  phosphoesterase  29.32 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195821  hitchhiker  0.0000667392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3825  phosphoesterase  29.17 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0357968  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0219  twin-arginine translocation pathway signal  37 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2663  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1710  metallophosphoesterase  28.47 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2609  metallophosphoesterase  33.78 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3492  metallophosphoesterase  26.76 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00129162  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0752  metallophosphoesterase  30.13 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.3941  normal  0.605397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3471  Ser/thr protein phosphatase family protein  28.57 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000520095  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3738  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.57 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18661e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0248  metallophosphoesterase  32.96 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0218  metallophosphoesterase  26.33 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0052  metallophosphoesterase  31.31 
 
 
441 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0288  metallophosphoesterase  31.95 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3572  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.19 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000400387  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0391  DNA repair exonuclease  28.26 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.903131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3856  Ser/thr protein phosphatase family protein  28.19 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000402293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3776  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.66 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000444173  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1644  metallophosphoesterase  30.8 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755879  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3484  Ser/thr protein phosphatase family protein  27.59 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0169244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3754  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.33 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2658  metallophosphoesterase  29.72 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00191858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2651  metallophosphoesterase  27.73 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  normal  0.283562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2400  metallophosphoesterase  28.84 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000977504  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2500  hypothetical protein  28.77 
 
 
251 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.786807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2693  metallophosphoesterase  25.4 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.559177  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1191  metallophosphoesterase  33.21 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28829  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3438  metallophosphoesterase  27.24 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3403  metallophosphoesterase  30.97 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0076  metallophosphoesterase  28.77 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.249391  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1048  metallophosphoesterase  32.21 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0157  phosphodiesterase YaeI  27.5 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1613  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.74 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000488599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3820  metallophosphoesterase  24.15 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8081  metallophosphoesterase  32.97 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4575  metallophosphoesterase  31.19 
 
 
383 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.752572  hitchhiker  0.0000097324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1144  metallophosphoesterase  32.68 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1817  metallophosphoesterase  30.55 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1211  metallophosphoesterase  28.29 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0399  metallophosphoesterase  33.56 
 
 
402 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1204  metallophosphoesterase  31.91 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.229661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1273  metallophosphoesterase  31.91 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1866  metallophosphoesterase  29.63 
 
 
335 aa  63.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00163  predicted phosphatase  27.46 
 
 
270 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3495  phosphodiesterase YaeI  27.27 
 
 
247 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00162  hypothetical protein  27.46 
 
 
270 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1410  metallophosphoesterase  28.25 
 
 
258 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000149653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0763  phosphohydrolases  30.6 
 
 
285 aa  62.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4041  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.3 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4113  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.3 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1023  metallophosphoesterase  30.99 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3152  metallophosphoesterase  35.87 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1370  phosphoesterase  29.5 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1649  hypothetical protein  29.5 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000129509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1582  hypothetical protein  29.5 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.70454e-36 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4096  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.93 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>