10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1853 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1853  putative TmrB-like protein  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0695  antibiotic resistance protein  88.15 
 
 		 211 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2145  hypothetical protein  40.49 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.949876  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0506  ATP-binding membrane protein  36.36 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.971484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3584  ATP-binding membrane protein  33.67 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0416  TmrB  34.29 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5646  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22473  normal  0.357497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4294  hypothetical protein  34.19 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5569  ATP/GTP binding protein  28.81 
 
 		 174 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.004333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4782  hypothetical protein  27.97 
 
 		 173 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  0.143006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>