12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1506 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1506  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2168  hypothetical protein  56.67 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  36.59 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0811  protein of unknown function DUF1232  50 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  33.72 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  35.9 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  36 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  36 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  67.86 
 
 		 145 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  48.65 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  48.65 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>