41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1552 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1552  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  346  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215305  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1204  inner membrane protein YcdZ  79.76 
 
 
170 aa  274  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.541907  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2235  inner membrane protein YcdZ  79.76 
 
 
170 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.800715 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1249  hypothetical protein  80.98 
 
 
164 aa  272  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.540058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2052  inner membrane protein YcdZ  80.98 
 
 
164 aa  272  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1234  inner membrane protein YcdZ  80.37 
 
 
164 aa  270  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698042  normal  0.958349 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2609  protein of unknown function DUF1097  81.88 
 
 
173 aa  268  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00104485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2563  hypothetical protein  81.88 
 
 
173 aa  268  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.232461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2097  hypothetical protein  81.88 
 
 
173 aa  268  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2293  hypothetical protein  83.77 
 
 
163 aa  263  8.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1155  hypothetical protein  83.77 
 
 
163 aa  263  8.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01040  hypothetical protein  83.12 
 
 
163 aa  262  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01033  predicted inner membrane protein  83.12 
 
 
163 aa  262  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1154  hypothetical protein  83.12 
 
 
163 aa  262  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.308865  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1415  hypothetical protein  84.11 
 
 
163 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0524852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3290  hypothetical protein  71.88 
 
 
164 aa  218  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0051  inner membrane protein  61.04 
 
 
166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05920  hypothetical protein  62.25 
 
 
206 aa  191  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000191  hypothetical protein  65.52 
 
 
160 aa  190  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0212289  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0476  hypothetical protein  58.02 
 
 
170 aa  187  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000160273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1663  hypothetical protein  44.36 
 
 
170 aa  114  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.601886  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1441  hypothetical protein  41.38 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1636  hypothetical protein  45.59 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2264  hypothetical protein  41.01 
 
 
164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00650617  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1506  hypothetical protein  41.38 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1498  hypothetical protein  41.38 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2821  hypothetical protein  42.96 
 
 
163 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105044  normal  0.367538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1631  protein of unknown function DUF1097  42.96 
 
 
163 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0765083  hitchhiker  0.000320926 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2745  hypothetical protein  42.96 
 
 
163 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1496  hypothetical protein  40.69 
 
 
150 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00154693  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3047  hypothetical protein  40.41 
 
 
163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1285  hypothetical protein  39.31 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0686848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2423  hypothetical protein  41.79 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2948  hypothetical protein  41.79 
 
 
170 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.733688  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2728  hypothetical protein  43.18 
 
 
134 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000943165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3548  hypothetical protein  41.18 
 
 
163 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2141  hypothetical protein  44.8 
 
 
154 aa  98.6  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2222  hypothetical protein  47.27 
 
 
175 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.118265  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0335  hypothetical protein  30.99 
 
 
165 aa  42  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0348  hypothetical protein  30.56 
 
 
165 aa  41.6  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0900  flavodoxin  30.61 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>