38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2728 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2745  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  267  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1631  protein of unknown function DUF1097  100 
 
 
163 aa  267  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0765083  hitchhiker  0.000320926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2821  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  267  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105044  normal  0.367538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2728  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  265  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000943165  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2423  hypothetical protein  95.52 
 
 
163 aa  259  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1441  hypothetical protein  92.54 
 
 
163 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1506  hypothetical protein  92.54 
 
 
163 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1498  hypothetical protein  92.54 
 
 
163 aa  256  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3047  hypothetical protein  91.04 
 
 
163 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1663  hypothetical protein  82.84 
 
 
170 aa  239  9e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.601886  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2264  hypothetical protein  74.63 
 
 
164 aa  216  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00650617  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1636  hypothetical protein  76.12 
 
 
162 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2948  hypothetical protein  71.64 
 
 
170 aa  207  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.733688  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3548  hypothetical protein  64.93 
 
 
163 aa  175  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2222  hypothetical protein  69.17 
 
 
175 aa  174  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.118265  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2141  hypothetical protein  51.28 
 
 
154 aa  121  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0476  hypothetical protein  43.28 
 
 
170 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000160273  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05920  hypothetical protein  44.53 
 
 
206 aa  116  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000191  hypothetical protein  41.79 
 
 
160 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0212289  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0051  inner membrane protein  48.39 
 
 
166 aa  114  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1234  inner membrane protein YcdZ  46.97 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698042  normal  0.958349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2235  inner membrane protein YcdZ  46.21 
 
 
170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.800715 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1204  inner membrane protein YcdZ  46.21 
 
 
170 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.541907  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2052  inner membrane protein YcdZ  46.21 
 
 
164 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1249  hypothetical protein  46.21 
 
 
164 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.540058 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2609  protein of unknown function DUF1097  46.21 
 
 
173 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00104485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2097  hypothetical protein  46.21 
 
 
173 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2563  hypothetical protein  46.21 
 
 
173 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.232461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2293  hypothetical protein  46.15 
 
 
163 aa  107  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271062  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1154  hypothetical protein  46.15 
 
 
163 aa  107  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.308865  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01040  hypothetical protein  46.15 
 
 
163 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01033  predicted inner membrane protein  46.15 
 
 
163 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1552  hypothetical protein  43.18 
 
 
174 aa  107  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215305  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1155  hypothetical protein  45.38 
 
 
163 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1415  hypothetical protein  45.45 
 
 
163 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0524852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3290  hypothetical protein  44.83 
 
 
164 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1496  hypothetical protein  36.72 
 
 
150 aa  88.6  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00154693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1285  hypothetical protein  36.72 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0686848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>