12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3182 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3182  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  976    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3550  hypothetical protein  63.43 
 
 		 464 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00024339  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0594  hypothetical protein  62.98 
 
 		 464 aa  615  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.754159  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01980  hypothetical protein  24.62 
 
 		 578 aa  72.4  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.350308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2912  hypothetical protein  23.92 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11025  hypothetical protein  22.02 
 
 		 567 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.026349  normal  0.556466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0322  hypothetical protein  25.45 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3209  hypothetical protein  24.5 
 
 		 561 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4753  beta-propeller repeat-containing protein  23.33 
 
 		 601 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  unclonable  0.0000000282965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4388  ypothetical protein  24.06 
 
 		 523 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1048  hypothetical protein  30.65 
 
 		 484 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00243617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4752  hypothetical protein  23.16 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000184435  hitchhiker  0.000000405781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>