16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3935 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3935  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03457  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0104  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3809  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.369662  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4101  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0110  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 69 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4019  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4972  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03408  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4011  hypothetical protein  79.1 
 
 		 69 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238739 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3966  hypothetical protein  79.1 
 
 		 69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.760828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3888  hypothetical protein  79.1 
 
 		 69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3904  hypothetical protein  79.1 
 
 		 69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4073  hypothetical protein  79.1 
 
 		 69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1945  DNA polymerase III, theta subunit  39.62 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000252468  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2241  DNA polymerase III, theta subunit  39.62 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>