16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1945 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1945  DNA polymerase III, theta subunit  100 
 
 		 65 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000252468  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2241  DNA polymerase III, theta subunit  100 
 
 		 65 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083279  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2963  hypothetical protein  52.38 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3035  hypothetical protein  52.38 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425889  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1864  hypothetical protein  50.79 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.0144491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3094  glycogen synthesis protein  33.96 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.74804  normal  0.0479358 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2126  DNA polymerase II beta subunit  46.67 
 
 		 76 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03457  hypothetical protein  39.62 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0104  conserved hypothetical protein  39.62 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3809  hypothetical protein  39.62 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.369662  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4101  hypothetical protein  39.62 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0110  putative cytoplasmic protein  39.62 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3935  hypothetical protein  39.62 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4019  hypothetical protein  39.62 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4972  hypothetical protein  39.62 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03408  hypothetical protein  39.62 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>