13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2429 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2429  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  340  5.999999999999999e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1385  Domain of unknown function DUF1877  97.01 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.733073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2421  hypothetical protein  97.01 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.710667  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02198  hypothetical protein  96.41 
 
 		 167 aa  330  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.537662  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1377  hypothetical protein  96.41 
 
 		 167 aa  330  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02158  hypothetical protein  96.41 
 
 		 167 aa  330  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2568  hypothetical protein  96.41 
 
 		 167 aa  330  7.000000000000001e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3414  hypothetical protein  95.81 
 
 		 167 aa  329  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.731883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2651  hypothetical protein  95.18 
 
 		 167 aa  324  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660811  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4161  hypothetical protein  30.18 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0563  hypothetical protein  32.81 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.132443  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1531  hypothetical protein  26.51 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.640919  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0871  hypothetical protein  37.18 
 
 		 85 aa  50.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.782987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>