16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1531 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1531  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  332  2e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.640919  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0563  hypothetical protein  49.7 
 
 
165 aa  143  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.132443  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4161  hypothetical protein  34.32 
 
 
168 aa  101  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0871  hypothetical protein  59.74 
 
 
85 aa  96.3  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.782987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2651  hypothetical protein  25.9 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.660811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2429  hypothetical protein  26.51 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02198  hypothetical protein  25.3 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.537662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1385  Domain of unknown function DUF1877  25.3 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.733073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2421  hypothetical protein  25.3 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.710667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1377  hypothetical protein  25.3 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3414  hypothetical protein  25.3 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.731883  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02158  hypothetical protein  25.3 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2568  hypothetical protein  25.3 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0030  hypothetical protein  25.29 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.816321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2601  hypothetical protein  28.45 
 
 
221 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2977  hypothetical protein  26.71 
 
 
163 aa  40.8  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0902672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>