23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0501 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3152  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36878  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00414  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0548  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0390  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  321  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0501  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3158  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  322  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0493  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  321  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0534  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  321  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00409  predicted inner membrane protein  100 
 
 		 156 aa  322  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0531  inner membrane protein YlaC  80.65 
 
 		 156 aa  246  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000248674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0512  inner membrane protein YlaC  80.65 
 
 		 156 aa  246  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706635  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0515  inner membrane protein YlaC  80.65 
 
 		 156 aa  246  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000163461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0521  inner membrane protein YlaC  80.65 
 
 		 156 aa  246  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000133537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0574  hypothetical protein  80.65 
 
 		 156 aa  246  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000270971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0938  putative inner membrane protein  73.38 
 
 		 155 aa  216  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1423  hypothetical protein  45.03 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1865  hypothetical protein  40.4 
 
 		 179 aa  124  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2522  hypothetical protein  41.72 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00100705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2747  hypothetical protein  40.51 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1522  Extracytoplasmic function sigma factor YlaC  40.51 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592247  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1627  hypothetical protein  35.04 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.880127  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1735  hypothetical protein  35.04 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2836  hypothetical protein  35.04 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.122781  normal  0.0464653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>