23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2522 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2522  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  326  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00100705  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1423  hypothetical protein  79.49 
 
 
158 aa  265  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1522  Extracytoplasmic function sigma factor YlaC  65.36 
 
 
163 aa  200  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592247  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2747  hypothetical protein  66.67 
 
 
163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1865  hypothetical protein  44.74 
 
 
179 aa  140  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1627  hypothetical protein  43.17 
 
 
177 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.880127  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2836  hypothetical protein  43.17 
 
 
177 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.122781  normal  0.0464653 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1735  hypothetical protein  43.17 
 
 
177 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0390  hypothetical protein  42.38 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00414  hypothetical protein  42.38 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0548  hypothetical protein  42.38 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292662  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00409  predicted inner membrane protein  42.38 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0501  hypothetical protein  42.38 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3158  hypothetical protein  42.38 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0493  hypothetical protein  42.38 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0534  hypothetical protein  42.38 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3152  conserved hypothetical protein  42.38 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36878  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0531  inner membrane protein YlaC  42.38 
 
 
156 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000248674  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0512  inner membrane protein YlaC  42.38 
 
 
156 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706635  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0515  inner membrane protein YlaC  42.38 
 
 
156 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000163461  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0521  inner membrane protein YlaC  42.38 
 
 
156 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000133537  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0574  hypothetical protein  42.38 
 
 
156 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000270971  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0938  putative inner membrane protein  39.74 
 
 
155 aa  113  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>