28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1084 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2668  hydrogenase-1 expression HyaE  100 
 
 		 132 aa  270  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.174346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00986  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  270  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.168201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2620  hydrogenase-1 operon protein HyaE  100 
 
 		 132 aa  270  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.871694  hitchhiker  0.00774525 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1091  hydrogenase-1 operon protein HyaE  100 
 
 		 132 aa  270  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0975866  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1084  hydrogenase-1 operon protein HyaE  100 
 
 		 132 aa  270  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00979  protein involved in processing of HyaA and HyaB proteins  100 
 
 		 132 aa  270  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.158587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2141  hydrogenase-1 operon protein HyaE  99.24 
 
 		 132 aa  269  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.270751  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1212  hydrogenase-1 operon protein HyaE  99.24 
 
 		 132 aa  267  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2339  hydrogenase-1 operon protein HyaE  98.48 
 
 		 132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1988  hydrogenase-1 operon protein HyaE  73.6 
 
 		 134 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1928  hydrogenase-1 operon protein HyaE  73.6 
 
 		 134 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.788328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1528  hydrogenase-1 operon protein HyaE  73.6 
 
 		 134 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.325234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1344  hydrogenase-1 operon protein HyaE  73.6 
 
 		 134 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1932  hydrogenase-1 operon protein HyaE  73.6 
 
 		 134 aa  197  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1705  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  36.36 
 
 		 136 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1646  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  34.26 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.769787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1637  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  34.26 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1802  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  34.26 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0548296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1638  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  33.33 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2024  hydrogenase-1 expression HyaE  33.03 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.328634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1969  hydrogenase-1 expression HyaE  36 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1291  hydrogenase-1 expression HyaE  36.79 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000102865  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2820  hypothetical protein  31.71 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3984  hydrogenase-1 expression HyaE  32.43 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7260  hydrogenase-1 expression HyaE  29.25 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352807  normal  0.532049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50540  hydrogenase expression/formation protein, HoxO  26.45 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130236  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1168  hydrogenase-1 expression HyaE  28.81 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2001  hydrogenase expression/formation  27.64 
 
 		 148 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.881912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>