12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_5012 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_R0069  tRNA-OTHER  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4646  tRNA-OTHER  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5012  tRNA-OTHER  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0083  tRNA-OTHER  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.597387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0358  tRNA-OTHER  100 
 
 		 81 bp  161  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.714214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0398  tRNA-OTHER  98.77 
 
 		 81 bp  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3535  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00377319  hitchhiker  0.000000298784 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1350  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0283084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1364  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.618401  normal  0.347437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1334  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.29476 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1935  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2119  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>