11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0021 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03566  arbutin specific enzyme IIBC component of PTS  98.45 
 
 		 1617 bp  3007    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0021    100 
 
 		 1878 bp  3723    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3894  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC component  99.73 
 
 		 1878 bp  3683    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4190  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC component  99.36 
 
 		 1878 bp  3628    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0020  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC subunit  98.64 
 
 		 1617 bp  3031    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4047  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC component  98.7 
 
 		 1617 bp  3039    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4237  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC component  99.66 
 
 		 1749 bp  2284    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5114  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC component  98.89 
 
 		 1617 bp  3063    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.424783 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03509  hypothetical protein  98.35 
 
 		 486 bp  900    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03510  hypothetical protein  98.55 
 
 		 1104 bp  2062    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0017  PTS system, alpha-glucoside-specific IIBC subunit  78.67 
 
 		 1617 bp  299  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>