15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1773 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1773  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  228  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0772608  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1528  hypothetical protein  99.12 
 
 
114 aa  224  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2255  hypothetical protein  99.12 
 
 
114 aa  224  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000312012 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2786  hypothetical protein  99.12 
 
 
114 aa  225  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.531617  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3877  hypothetical protein  99.12 
 
 
114 aa  224  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1269  hypothetical protein  97.37 
 
 
114 aa  221  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2185  hypothetical protein  98.08 
 
 
135 aa  203  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000651475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0945  hypothetical protein  66.07 
 
 
114 aa  149  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268518  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1645  hypothetical protein  62.28 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000957166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1182  hypothetical protein  63.39 
 
 
116 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000101363  hitchhiker  0.0000000000286318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01335  conserved hypothetical protein  62.5 
 
 
114 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.286861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01344  hypothetical protein  62.5 
 
 
114 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.2908  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1449  hypothetical protein  55.29 
 
 
104 aa  97.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2089  protein of unknown function DUF1327  45.95 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000665043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2082  hypothetical protein  45.95 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639539  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>