15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01335 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01335  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  233  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.286861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01344  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  233  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.2908  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1182  hypothetical protein  96.46 
 
 		 116 aa  224  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000101363  hitchhiker  0.0000000000286318 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0945  hypothetical protein  93.86 
 
 		 114 aa  219  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.268518  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1645  hypothetical protein  92.86 
 
 		 183 aa  218  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000957166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1449  hypothetical protein  95.24 
 
 		 104 aa  163  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1528  hypothetical protein  63.39 
 
 		 114 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2255  hypothetical protein  63.39 
 
 		 114 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000312012 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3877  hypothetical protein  63.39 
 
 		 114 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1269  hypothetical protein  63.39 
 
 		 114 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1773  hypothetical protein  62.5 
 
 		 114 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0772608  normal  0.0130846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2786  hypothetical protein  62.5 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.531617  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2089  protein of unknown function DUF1327  79.73 
 
 		 103 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000665043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2082  hypothetical protein  79.73 
 
 		 103 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2185  hypothetical protein  60.78 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000651475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>