12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0297 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0297  replication protein P for prophage CP-933H  100 
 
 		 103 aa  210  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.412788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0818  putative bacteriophage protein  87.8 
 
 		 226 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1177  putative bacteriophage protein  80.49 
 
 		 226 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.223449  normal  0.0715327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2411  putative bacteriophage protein  39.51 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1802  hypothetical protein  32.95 
 
 		 502 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2244  putative bacteriophage protein  40.51 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.433494 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10025  DNA replication protein  100 
 
 		 233 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1120  replication protein P  100 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  0.739482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1601  replication protein P  100 
 
 		 233 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102018 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3552  replication protein P  100 
 
 		 233 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0821643  hitchhiker  6.45251e-16 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00722  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0811  replication protein P  95.24 
 
 		 233 aa  42.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0802676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>