23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01538 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01538  transcriptional repressor of cell division inhibition protein  100 
 
 		 76 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0333646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1754  DNA-binding transcriptional regulator DicC  93.24 
 
 		 75 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163478  hitchhiker  0.000166597 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2074  DNA-binding transcriptional regulator DicC  85.53 
 
 		 76 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2059  DNA-binding transcriptional regulator DicC  85.53 
 
 		 76 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.26685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1777  DNA-binding transcriptional regulator DicC  85.53 
 
 		 76 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3168  DNA-binding transcriptional regulator DicC  77.03 
 
 		 75 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000339989  hitchhiker  5.09269e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1831  DNA-binding transcriptional regulator DicC  77.03 
 
 		 75 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000135979  hitchhiker  0.000000000000143689 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1159  DNA-binding transcriptional regulator DicC  77.03 
 
 		 75 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630575  hitchhiker  4.7750399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1422  DNA-binding transcriptional regulator DicC  76 
 
 		 84 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000013818  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01530  hypothetical protein  100 
 
 		 42 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0236056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2247  hypothetical protein  41.38 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0769  hypothetical protein  39.29 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0741  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2021  hypothetical protein  47.06 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0532062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3615  hypothetical protein  45.1 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0550538  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2562  hypothetical protein  47.06 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3370  hypothetical protein  46.81 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000378314  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0768  hypothetical protein  45.1 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.100263  normal  0.245457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1966  hypothetical protein  36.54 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427154  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3494  hypothetical protein  44.68 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000638344  unclonable  0.00000710408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0290  regulatory protein Cro  36.84 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10022  Regulatory protein cro (Antirepressor)  36.84 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3267  hypothetical protein  38.46 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000286542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>