46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2419 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2419  flagellar assembly protein FliW  100 
 
 
173 aa  348  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.423984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2527  flagellar assembly protein FliW  75.86 
 
 
183 aa  231  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3149  flagellar assembly protein FliW  71.72 
 
 
168 aa  222  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212103  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1998  flagellar assembly protein FliW  57.14 
 
 
166 aa  174  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2400  flagellar assembly protein FliW  45.07 
 
 
156 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  34.43 
 
 
146 aa  95.1  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  31.97 
 
 
142 aa  85.1  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0081  hypothetical protein  34.09 
 
 
162 aa  84.7  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0195  hypothetical protein  36.84 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  35.77 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  34.07 
 
 
159 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2233  flagellar assembly protein FliW  33.33 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000631817 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0866  flagellar assembly protein FliW  34.71 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0843  flagellar assembly protein FliW  34.71 
 
 
149 aa  79  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0749  hypothetical protein  30.89 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.746617 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0605  flagellar assembly protein FliW  30.89 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  29.2 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2354  flagellar assembly protein FliW  33.58 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0020  protein of unknown function DUF180  37.69 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  29.27 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  34.78 
 
 
144 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0441  flagellar assembly protein FliW  34.71 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  34.96 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  33.33 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  33.61 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0820  flagellar assembly protein FliW  39.02 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.900553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2743  flagellar assembly protein FliW  33.58 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4096  flagellar assembly protein FliW  34.71 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3040  flagellar assembly protein FliW  31.4 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0391  hypothetical protein  31.71 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1146  flagellar assembly protein FliW  29.27 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0667  protein of unknown function DUF180  28.1 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0098  flagellar assembly protein FliW  29.51 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1619  protein of unknown function DUF180  32.41 
 
 
135 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2416  hypothetical protein  32.17 
 
 
136 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0389  hypothetical protein  27.82 
 
 
154 aa  58.2  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.166292  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0830  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.258231  normal  0.70699 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0210  protein of unknown function DUF180  33.33 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.945041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2359  protein of unknown function DUF180  34.82 
 
 
170 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  31.62 
 
 
135 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0183  flagellar assembly protein FliW  25.2 
 
 
130 aa  55.5  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17100  hypothetical protein  27.27 
 
 
156 aa  52  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0308  hypothetical protein  28.68 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  31.03 
 
 
136 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0959  flagellar assembly protein FliW  28.95 
 
 
131 aa  49.3  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0991  protein of unknown function DUF180  25.98 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>