32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0210 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0210  protein of unknown function DUF180  100 
 
 
156 aa  309  9e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.945041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3149  flagellar assembly protein FliW  33.62 
 
 
168 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0195  hypothetical protein  26.95 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  29.75 
 
 
165 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0098  flagellar assembly protein FliW  28.7 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  28.57 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2419  flagellar assembly protein FliW  33.33 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.423984 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  28.67 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  33.62 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2527  flagellar assembly protein FliW  32.43 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  34.85 
 
 
136 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0389  hypothetical protein  36 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.166292  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  31.25 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  31.3 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2743  flagellar assembly protein FliW  33.65 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  31.48 
 
 
144 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0830  hypothetical protein  33.09 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.258231  normal  0.70699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  27.83 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0820  flagellar assembly protein FliW  33.98 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.900553  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0183  flagellar assembly protein FliW  23.81 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  31.03 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17100  hypothetical protein  22.31 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2359  protein of unknown function DUF180  34.71 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  23.64 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2233  flagellar assembly protein FliW  25.41 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000631817 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2354  flagellar assembly protein FliW  26.47 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1998  flagellar assembly protein FliW  30.77 
 
 
166 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  36.21 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2400  flagellar assembly protein FliW  28.7 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0858  protein of unknown function DUF180  27.35 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3040  flagellar assembly protein FliW  31.4 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2416  hypothetical protein  29.09 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>