15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2221 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2221  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  238  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2727  hypothetical protein  88.03 
 
 
142 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2218  hypothetical protein  87.18 
 
 
117 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2203  hypothetical protein  88.89 
 
 
117 aa  209  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.818245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2728  hypothetical protein  94.02 
 
 
117 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2700  hypothetical protein  67.8 
 
 
116 aa  154  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380069  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2662  hypothetical protein  64.41 
 
 
116 aa  150  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.311473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1429  hypothetical protein  72.03 
 
 
115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.82123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2418  hypothetical protein  67.8 
 
 
176 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38321  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1086  hypothetical protein  55.93 
 
 
116 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1717  hypothetical protein  51.3 
 
 
116 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2445  hypothetical protein  41.18 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.133005  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2100  hypothetical protein  31.82 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2387  hypothetical protein  31.82 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00036703  normal  0.166527 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1628  hypothetical protein  37.5 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.130084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>