15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2728 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2728  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  236  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2727  hypothetical protein  87.18 
 
 
142 aa  206  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2218  hypothetical protein  84.62 
 
 
117 aa  203  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2203  hypothetical protein  84.62 
 
 
117 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.818245  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2221  hypothetical protein  94.02 
 
 
117 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2662  hypothetical protein  64.1 
 
 
116 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.311473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2700  hypothetical protein  65.81 
 
 
116 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380069  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1429  hypothetical protein  69.23 
 
 
115 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.82123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2418  hypothetical protein  64.96 
 
 
176 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38321  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1086  hypothetical protein  55.83 
 
 
116 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1717  hypothetical protein  50.43 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2445  hypothetical protein  41.18 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.133005  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2100  hypothetical protein  32.43 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2387  hypothetical protein  32.43 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00036703  normal  0.166527 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1628  hypothetical protein  35.06 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.130084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>