31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4011 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4011  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  353  5.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.498018  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3729  hypothetical protein  93.02 
 
 		 172 aa  328  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5839  hypothetical protein  58.75 
 
 		 172 aa  200  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1412  hypothetical protein  57.79 
 
 		 168 aa  191  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.298721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1132  hypothetical protein  57.79 
 
 		 168 aa  191  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03515  hypothetical protein  59.03 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1267  hypothetical protein  54 
 
 		 155 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1416  hypothetical protein  48.45 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4639  hypothetical protein  58.33 
 
 		 167 aa  165  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5360  hypothetical protein  53.42 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0813424 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0281  hypothetical protein  55.56 
 
 		 167 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0570  hypothetical protein  46.26 
 
 		 154 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3320  hypothetical protein  46.26 
 
 		 154 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3610  hypothetical protein  45.58 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4444  hypothetical protein  47.45 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.810887 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0575  hypothetical protein  47.45 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3427  hypothetical protein  47.45 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2868  hypothetical protein  44.2 
 
 		 155 aa  131  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4954  hypothetical protein  43.54 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.655771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2743  hypothetical protein  42.75 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.79466  normal  0.376957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4188  hypothetical protein  43.17 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310798  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3433  hypothetical protein  42.03 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.703957  normal  0.315896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1247  hypothetical protein  42.45 
 
 		 152 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1175  hypothetical protein  41.73 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0692  hypothetical protein  42.66 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0844  hypothetical protein  46.28 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0356671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1061  hypothetical protein  40.82 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.726656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02995  hypothetical protein  45.1 
 
 		 106 aa  97.8  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2097  hypothetical protein  34.4 
 
 		 128 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0808696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2121  hypothetical protein  34.13 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.71998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0482  hypothetical protein  49.06 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>