13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0989 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0989  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  159  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53937  normal  0.7457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2864  hypothetical protein  94.94 
 
 		 79 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.856871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0274  hypothetical protein  65.82 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00484181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4759  hypothetical protein  59.74 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0326  hypothetical protein  56.72 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0892  hypothetical protein  50.7 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00298752  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6148  hypothetical protein  46.25 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260422  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0971  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.636735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6743  hypothetical protein  47.22 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0282128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3544  phage transcriptional regulator, AlpA  45.1 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6292  hypothetical protein  48.28 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1301  hypothetical protein  38.33 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3429  hypothetical protein  34.78 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780985  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>