11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0624 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0370    99.35 
 
 		 6856 bp  1191    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.542855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0376  Integrase catalytic region  99.35 
 
 		 978 bp  1191    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000454687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0624    100 
 
 		 4479 bp  8879    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000724302  unclonable  0.000000000702649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1338 bp  2652    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000035382  unclonable  0.0000000000654827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0626  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  100 
 
 		 1326 bp  2629    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000304657  hitchhiker  0.00000002328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  98.65 
 
 		 1338 bp  2510    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000912267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  98.36 
 
 		 1338 bp  2478    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2536  Integrase catalytic region  98.38 
 
 		 978 bp  1144    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000616979  normal  0.891736 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0274    94.87 
 
 		 291 bp  61.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1541  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 957 bp  54  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3821  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 957 bp  54  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000253663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>