11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0370 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0370    100 
 
 		 6856 bp  13590    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.542855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0375  putative transposase  100 
 
 		 483 bp  957    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000100064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0376  Integrase catalytic region  100 
 
 		 978 bp  1939    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000454687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0623    99.73 
 
 		 381 bp  731    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231643  hitchhiker  0.0000000808651 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0624    99.35 
 
 		 4479 bp  1191    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000724302  unclonable  0.000000000702649 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2535  putative transposase  99.17 
 
 		 483 bp  926    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000152425  normal  0.735712 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2536  Integrase catalytic region  99.08 
 
 		 978 bp  1867    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000616979  normal  0.891736 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2525    97.06 
 
 		 746 bp  60  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.011661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1541  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 957 bp  54  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3821  integrase catalytic subunit  90.7 
 
 		 957 bp  54  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000253663  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2528  hypothetical protein  100 
 
 		 777 bp  50.1  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>