16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0237 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0237  ribosomal protein L14E  100 
 
 
102 aa  210  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0497204  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1502  hypothetical protein  44.05 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0308  hypothetical protein  37.21 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.645351  normal  0.23626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2926  hypothetical protein  39.29 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555048  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2689  hypothetical protein  36.59 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00663188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0247  hypothetical protein  36.36 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000395429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01390  hypothetical protein  32.58 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000837081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0217  hypothetical protein  32.97 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.934654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0781  hypothetical protein  43.24 
 
 
93 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000322443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2437  hypothetical protein  31.76 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0889  hypothetical protein  39.76 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000153161  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2691  hypothetical protein  31.08 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2376  hypothetical protein  31.08 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1161  hypothetical protein  31.58 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00111395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2310  hypothetical protein  35.48 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000110509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1723  hypothetical protein  35.9 
 
 
89 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000883961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>