11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2376 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2376  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  200  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2691  hypothetical protein  99.02 
 
 
102 aa  197  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2926  hypothetical protein  50.77 
 
 
90 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0247  hypothetical protein  35.06 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000395429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01390  hypothetical protein  35.63 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000837081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0889  hypothetical protein  44.3 
 
 
88 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000153161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0781  hypothetical protein  36.71 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000322443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1502  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0308  hypothetical protein  30.59 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.645351  normal  0.23626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0217  hypothetical protein  44.9 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.934654 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0237  ribosomal protein L14E  31.08 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0497204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>