16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2806 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2793  transposase, IS4  99.16 
 
 
363 aa  239  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2797  transposase, IS4  99.16 
 
 
363 aa  239  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2806  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  239  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2763  transposase, IS4  96.64 
 
 
363 aa  232  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.679424  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3088  transposase IS4 family protein  92.44 
 
 
363 aa  221  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1702  transposase, IS4  66.39 
 
 
363 aa  150  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2430  transposase, IS4  66.39 
 
 
363 aa  150  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2659  transposase, IS4  66.39 
 
 
363 aa  150  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2823  transposase, IS4  66.39 
 
 
363 aa  150  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0308  transposase, IS4  66.39 
 
 
363 aa  150  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0464  transposase, IS4  66.39 
 
 
363 aa  150  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0293358  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0925  transposase, IS4  66.39 
 
 
363 aa  150  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.310658  normal  0.553314 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2108  transposase, IS4  66.39 
 
 
363 aa  150  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.958109 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2205  transposase, IS4  66.39 
 
 
363 aa  150  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2301  hypothetical protein  63.87 
 
 
281 aa  145  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1807  transposase, IS4  67.42 
 
 
333 aa  115  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.911781  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>