23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1171 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1171  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  524  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0508907  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1595  hypothetical protein  26.46 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.010794  unclonable  1.4999500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0192  hypothetical protein  27.51 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0444  esterase  28.14 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4721  esterase  25.39 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4434  esterase  26.17 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4751  esterase  25.78 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1546  hypothetical protein  31.91 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3803  phospholipase/Carboxylesterase  26.09 
 
 
249 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3823  esterase  26.17 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000203286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4662  esterase  25.78 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.68752 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5707  esterase  26.09 
 
 
249 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04019  hypothetical protein  25.69 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04057  predicted hydrolase  25.69 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0720  hypothetical protein  30.65 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4741  esterase  26.88 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4648  esterase  27.27 
 
 
249 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4658  esterase  27.27 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4777  esterase  27.27 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4798  esterase  30.71 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  26.09 
 
 
242 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 
314 aa  42  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  33.33 
 
 
258 aa  42  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>