12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1111 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1111  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
321 aa  659    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2391  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2481  hypothetical protein  34.6 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.002341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1189  hypothetical protein  34.47 
 
 
407 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00874894  decreased coverage  0.00120085 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3056  aminoglycoside phosphotransferase  32.17 
 
 
350 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17542 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  26.23 
 
 
317 aa  63.2  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  32.88 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0749  homoserine kinase  25.6 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1059  homoserine kinase  26.83 
 
 
321 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  24.48 
 
 
327 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  32.35 
 
 
667 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  23.61 
 
 
327 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.818209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>