12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1712 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1712  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2924  nucleic acid-binding protein  37.04 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3256  nucleic acid-binding protein  33.33 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00062  PIN domain, putative  29.45 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0134903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3514  PilT protein domain protein  27.85 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.522496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2595  PilT domain-containing protein  30.63 
 
 		 132 aa  44.7  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.129291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2132  PilT protein-like  28.12 
 
 		 133 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.0299917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2684  PilT protein domain protein  28.48 
 
 		 132 aa  44.3  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285595  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0447  PilT protein-like  30 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.289411 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0069  hypothetical protein  35.94 
 
 		 81 aa  41.6  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.508725  normal  0.755848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3221  hypothetical protein  28.48 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1920  PilT protein  26.88 
 
 		 133 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>