13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3104 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3104  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1270  hypothetical protein  76.53 
 
 
311 aa  433  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3229  hypothetical protein  48.54 
 
 
310 aa  301  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.832062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3329  hypothetical protein  48.37 
 
 
310 aa  299  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6166  hypothetical protein  50.8 
 
 
310 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.335866  normal  0.687763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2954  hypothetical protein  49.2 
 
 
312 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6303  nucleoside recognition domain protein  36.27 
 
 
307 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1029  hypothetical protein  36.93 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1293  nucleoside recognition domain protein  42.31 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1141  nucleoside recognition domain-containing protein  44.12 
 
 
176 aa  45.8  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1355  nucleoside recognition  46.38 
 
 
177 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2094  nucleoside recognition domain protein  34.88 
 
 
176 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3721  nucleoside recognition domain protein  32.58 
 
 
419 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0225347  normal  0.0367959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>