22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0560 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0560  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  319  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0732  hypothetical protein  50.65 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3247  hypothetical protein  49.36 
 
 		 156 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3327  hypothetical protein  48.7 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61450  hypothetical protein  47.71 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.428854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5293  hypothetical protein  47.71 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0748  hypothetical protein  44.08 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0620  hypothetical protein  43.31 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0776  hypothetical protein  43.42 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0789  hypothetical protein  44.08 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4441  hypothetical protein  45.39 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02633  hypothetical protein  41.83 
 
 		 180 aa  120  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1896  hypothetical protein  36.02 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0034  hypothetical protein  40.48 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2080  hypothetical protein  41.73 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0927  hypothetical protein  33.76 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000534724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0187  hypothetical protein  37.88 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0984  hypothetical protein  36.05 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.229596  normal  0.532531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3978  hypothetical protein  37.33 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5656  hypothetical protein  33.58 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1319  O-antigen related protein  26.47 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0766792  normal  0.774627 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12991  hypothetical protein  27.78 
 
 		 151 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>