20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5293 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5293  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  320  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61450  hypothetical protein  94.87 
 
 
157 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.428854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0748  hypothetical protein  72.44 
 
 
157 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117939  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0789  hypothetical protein  69.87 
 
 
157 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0776  hypothetical protein  69.87 
 
 
157 aa  223  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4441  hypothetical protein  66.03 
 
 
157 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0560  hypothetical protein  47.71 
 
 
159 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0732  hypothetical protein  41.83 
 
 
154 aa  130  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3247  hypothetical protein  43.05 
 
 
156 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3327  hypothetical protein  42.48 
 
 
154 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1896  hypothetical protein  40.51 
 
 
165 aa  120  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0984  hypothetical protein  39.6 
 
 
160 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.229596  normal  0.532531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0927  hypothetical protein  35.33 
 
 
156 aa  110  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000534724  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0620  hypothetical protein  37.91 
 
 
159 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0034  hypothetical protein  37.24 
 
 
159 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02633  hypothetical protein  36.73 
 
 
180 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2080  hypothetical protein  34.44 
 
 
158 aa  94  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3978  hypothetical protein  34.27 
 
 
169 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0187  hypothetical protein  35.07 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5656  hypothetical protein  30.22 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>