8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0874 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0874  rhodopsin  100 
 
 		 233 aa  463  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000448846 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3927  rhodopsin  40 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3441  rhodopsin  28 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000429167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2037  rhodopsin  27.32 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0085  rhodopsin  23.47 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2680  rhodopsin  24 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.452859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0537  rhodopsin  24.43 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326912  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0448  rhodopsin  22.53 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.937786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>