13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0313 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0313  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  688    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1351  hypothetical protein  36.84 
 
 		 347 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.429958  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1558  hypothetical protein  37.13 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3208  hypothetical protein  28.86 
 
 		 338 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.232476  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0151  hypothetical protein  26.24 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4602  hypothetical protein  27.24 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00017317  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23700  hypothetical protein  22.63 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000660407  normal  0.616861 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1073  hypothetical protein  20.35 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.953828  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3544  putative phage associated protein  24.67 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.22675  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1441  hypothetical protein  19.56 
 
 		 352 aa  49.3  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.593094  normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00112  hypothetical protein  23.25 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1076  hypothetical protein  22.28 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2069  hypothetical protein  21.9 
 
 		 378 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000456002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>