12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_R0010 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_R0010  tRNA-His  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0038  tRNA-His  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.650606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0014  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0720319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0068  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.064456  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t41  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0465377  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0025  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132615  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1960  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.775984  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0011  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.418229  normal  0.712568 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.894814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0013  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0037  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0220661  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1399  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.756645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>