19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5618 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5618  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2033  fatty acid hydroxylase  59.72 
 
 		 158 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0059  carotene hydroxylase  60.87 
 
 		 146 aa  187  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2089  fatty acid hydroxylase  53.69 
 
 		 152 aa  172  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.213926  normal  0.0390398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2038  beta-carotene hydroxylase  56.43 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0223903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00925  beta carotene hydroxylase  52 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5702  fatty acid hydroxylase  46.94 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1168  carotene hydroxylase  43.71 
 
 		 176 aa  113  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1710  fatty acid hydroxylase  43.17 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  0.199306 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0482  fatty acid hydroxylase  49.17 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4535  carotene hydroxylase  42.52 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2128  carotene hydroxylase  42.55 
 
 		 200 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2665  fatty acid hydroxylase  35.21 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0702  fatty acid hydroxylase  38.76 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1074  carotene hydroxylase  41.27 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3246  beta-carotene hydroxylase  35.81 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2516  carotene hydroxylase  35.81 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2647  fatty acid hydroxylase  37.12 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.810487  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_9013  predicted protein  35.05 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0252602  normal  0.0220603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>