12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0507 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0507  protein of unknown function DUF1239  100 
 
 		 184 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3270  hypothetical protein  31.36 
 
 		 174 aa  84.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1299  protein of unknown function DUF1239  32.2 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.828196 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0413  protein of unknown function DUF1239  25 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393181 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4027  hypothetical protein  28.03 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0450  hypothetical protein  24.29 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0877057 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0774  protein of unknown function DUF1239  25.27 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0476  hypothetical protein  30.19 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04210  hypothetical protein  24.4 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.215001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1413  hypothetical protein  20.93 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.934986  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0593  hypothetical protein  22.65 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0311  protein of unknown function DUF1239  27.1 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.287368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>