11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1953 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1938  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  110  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00261957  normal  0.808893 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1953  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  110  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0608  PilT protein domain protein  61.22 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.332384  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  56.52 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  52.17 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  47.83 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1292  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  42.22 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  42.55 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  42.55 
 
 		 128 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.442383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>