14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0469 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0469  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  872    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1928  hypothetical protein  47.51 
 
 
423 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126858  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00115  hypothetical protein  42.35 
 
 
424 aa  350  2e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3068  hypothetical protein  40.43 
 
 
426 aa  307  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.314046  hitchhiker  0.000664574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1964  hypothetical protein  33.68 
 
 
474 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000446922  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2413  hypothetical protein  32.55 
 
 
426 aa  266  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495217  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0589  hypothetical protein  37.94 
 
 
434 aa  262  8e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0436  hypothetical protein  35.65 
 
 
429 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205237  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2696  hypothetical protein  34.35 
 
 
431 aa  247  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0949218  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2214  hypothetical protein  32.56 
 
 
424 aa  203  5e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1976  hypothetical protein  29.01 
 
 
425 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1813  hypothetical protein  24.89 
 
 
407 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1121  hypothetical protein  24.58 
 
 
457 aa  91.7  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2812  hypothetical protein  49.3 
 
 
426 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  hitchhiker  0.00271322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>