47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1333 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1333  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  178  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3212  GNAT family acetyltransferase  57.47 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.649862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3025  acetyltransferase, gnat family  57.47 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3093  GNAT family acetyltransferase  57.47 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3108  acetyltransferase, gnat family  57.47 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142937 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3838  hypothetical protein  66.67 
 
 		 175 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1842  hypothetical protein  64.37 
 
 		 176 aa  88.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2940  GCN5-related N-acetyltransferase  42.67 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4307  hypothetical protein  50.62 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2320  hypothetical protein  64.37 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2345  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1620  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4537  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.69779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1212  GCN5-related N-acetyltransferase  41.56 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2748  GCN5-related N-acetyltransferase  39.47 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2840  hypothetical protein  49.23 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4424  hypothetical protein  32.5 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000808902  normal  0.0637784 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4607  hypothetical protein  32.5 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.776169 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4403  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.527623 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2101  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0948577  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4862  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  38.75 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.268854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2580  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448708  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02184  hypothetical protein  34.62 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2856  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1273  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.375788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4777  hypothetical protein  38.16 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0787  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3939  hypothetical protein  38.16 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4664  acetyltransferase, gnat family  33.33 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.374282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4573  acetyltransferase, gnat family  33.33 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.283887  normal  0.34039 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1717  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.400232  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4713  GNAT family acetyltransferase  33.33 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.158264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1354  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3429  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4868  hypothetical protein  33.75 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39800  N-acetyltransferase  36.76 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10937  hypothetical protein  34.67 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2852  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.766194  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2044  acetyltransferase  32.91 
 
 		 164 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0252037  hitchhiker  0.0082422 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0281  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 		 163 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3602  hypothetical protein  33.85 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000320935  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3547  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0265536  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4727  acetyltransferase, gnat family  35.21 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>