24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2334 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2334  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0355471  decreased coverage  0.000000483756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2516  hypothetical protein  52 
 
 
233 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.441115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09320  hypothetical protein  45.54 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.54682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1410  hypothetical protein  38.54 
 
 
223 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  decreased coverage  0.00637292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3817  integral membrane protein  48.04 
 
 
209 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417519  normal  0.0124075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2714  integral membrane protein  39 
 
 
245 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0139208  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13721  hypothetical protein  33.17 
 
 
217 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.335566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4819  hypothetical protein  31.86 
 
 
227 aa  85.9  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5453  hypothetical protein  35.18 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792473  normal  0.286575 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4947  hypothetical protein  44.55 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767302  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5226  hypothetical protein  44.55 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4858  hypothetical protein  44.55 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1339  hypothetical protein  45.37 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3747  putative integral membrane protein  39.01 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2498  putative integral membrane protein  37.23 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.507702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7596  putative integral membrane protein  49.44 
 
 
262 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  0.0253276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1830  hypothetical protein  31.11 
 
 
213 aa  72  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.884278  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4046  hypothetical protein  55.88 
 
 
223 aa  72  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3908  integral membrane protein  37.1 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2445  integral membrane protein  38 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0761  putative integral membrane protein  39.6 
 
 
266 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20670  hypothetical protein  36 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0562774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5844  putative integral membrane protein  41.35 
 
 
259 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1847  hypothetical protein  35.79 
 
 
190 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>