23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1542 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1542  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  157  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.294651  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23210  hypothetical protein  64 
 
 
79 aa  98.6  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342984  normal  0.0901448 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1040  hypothetical protein  57.89 
 
 
88 aa  87  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1241  hypothetical protein  57.33 
 
 
93 aa  83.6  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10520  hypothetical protein  50.77 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.550501  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2130  hypothetical protein  51.67 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2176  hypothetical protein  51.67 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.572915  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2117  hypothetical protein  51.67 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449177  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2402  hypothetical protein  48.33 
 
 
64 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0371811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1461  hypothetical protein  48.53 
 
 
74 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000951069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2452  hypothetical protein  41.89 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307643  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2338  hypothetical protein  45.31 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1418  hypothetical protein  45.31 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1459  hypothetical protein  45.59 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00288018  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3983  hypothetical protein  43.33 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262413  normal  0.447927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2201  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1493  hypothetical protein  41.67 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.910694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3995  hypothetical protein  36.36 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00216255  normal  0.238179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1782  hypothetical protein  36.92 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0665  hypothetical protein  41.18 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  0.162139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0802  hypothetical protein  33.33 
 
 
82 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.139948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17700  hypothetical protein  39.62 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.578813  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3920  hypothetical protein  33.33 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>