27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1782 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1782  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  128  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2130  hypothetical protein  59.38 
 
 
64 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2176  hypothetical protein  59.38 
 
 
64 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.572915  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2117  hypothetical protein  59.38 
 
 
64 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449177  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2402  hypothetical protein  56.25 
 
 
64 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0371811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3983  hypothetical protein  57.81 
 
 
64 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.262413  normal  0.447927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2201  hypothetical protein  59.38 
 
 
64 aa  80.1  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27830  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0214542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3995  hypothetical protein  45 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00216255  normal  0.238179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1418  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3526  hypothetical protein  48.33 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.839258  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3920  hypothetical protein  41.94 
 
 
71 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0665  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  0.162139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23210  hypothetical protein  44.44 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342984  normal  0.0901448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1218  hypothetical protein  43.33 
 
 
69 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114739  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1493  hypothetical protein  38.33 
 
 
64 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.910694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1241  hypothetical protein  44.62 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1040  hypothetical protein  43.08 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1461  hypothetical protein  42.86 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000951069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0802  hypothetical protein  36.67 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.139948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1459  hypothetical protein  39.68 
 
 
74 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00288018  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17700  hypothetical protein  42.31 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.578813  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1542  hypothetical protein  36.92 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.294651  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10520  hypothetical protein  40 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.550501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2214  hypothetical protein  38.33 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3297  hypothetical protein  35 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07220  hypothetical protein  40.32 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.281963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>