23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1522 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1522  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  313  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23340  hypothetical protein  60.99 
 
 
152 aa  149  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863031  normal  0.0195601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1220  hypothetical protein  60.63 
 
 
155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14720  hypothetical protein  48.55 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2228  hypothetical protein  46.58 
 
 
160 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165353  normal  0.456563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2471  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.24 
 
 
147 aa  113  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.514415  normal  0.576006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1451  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.17 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000199447 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1449  TPR repeat-containing protein  42.65 
 
 
157 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262816  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1028  hypothetical protein  48.78 
 
 
167 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7873  hypothetical protein  39.04 
 
 
149 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5820  hypothetical protein  42.11 
 
 
150 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2173  hypothetical protein  37.41 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142438  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07130  hypothetical protein  44.29 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4012  TPR repeat-containing protein  39.86 
 
 
155 aa  84  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678483  decreased coverage  0.00532252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2375  tetratricopeptide TPR_2  38.06 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0445663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3552  hypothetical protein  35.29 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.497079  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1757  hypothetical protein  35.66 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2154  TPR repeat-containing protein  40.32 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2108  tetratricopeptide TPR_2  40.32 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2091  TPR repeat-containing protein  39.52 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12785  transmembrane protein  50 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.443244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1469  conserved hypothetical secreted protein  45.83 
 
 
149 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.22177 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10410  hypothetical protein  28.57 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0104588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>