16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10410 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_10410  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  259  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0104588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2228  hypothetical protein  35.62 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165353  normal  0.456563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2173  hypothetical protein  31.43 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142438  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5820  hypothetical protein  32 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1449  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262816  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14720  hypothetical protein  30.34 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.100012  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1451  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.89 
 
 
159 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000199447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7873  hypothetical protein  32.38 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157939 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4012  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678483  decreased coverage  0.00532252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3552  hypothetical protein  29.01 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.497079  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2375  tetratricopeptide TPR_2  27.66 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0445663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2108  tetratricopeptide TPR_2  26.19 
 
 
154 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2154  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
154 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.289892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2091  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.100902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07130  hypothetical protein  35.48 
 
 
172 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12785  transmembrane protein  33.09 
 
 
157 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.443244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>