12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1937 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1937  copper amine oxidase domain protein  100 
 
 
647 aa  1310    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1718  copper amine oxidase domain protein  21.85 
 
 
634 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000557029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  25.47 
 
 
282 aa  54.7  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  21.77 
 
 
289 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.09 
 
 
657 aa  48.9  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1371  copper amine oxidase domain protein  27.68 
 
 
531 aa  48.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000791352  hitchhiker  0.00000351269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  32 
 
 
553 aa  47.8  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  32.12 
 
 
291 aa  47.4  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  30.61 
 
 
263 aa  47.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1228  copper amine oxidase-like  23.19 
 
 
559 aa  44.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175473  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  25.32 
 
 
481 aa  45.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  27.82 
 
 
456 aa  44.7  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>